Фармакотерапия (pharmacotherapia, от греческого φάρμακον — «снадобье, лекарство» и θερᾰπεία — «лечение») — лечение больного лекарственными средствами. Является одним из основных методов консервативного лечения.

Современная фармакотерапия представляет собой быстро развивающееся направление клинической медицины, разрабатывающее научно обоснованную систему принципов применения лекарственных средств с целью ликвидации, прерывания или замедления развития болезни воздействием этих средств на её причину или ведущие звенья патогенеза, а также с целью устранения наиболее тягостных или прогностически неблагоприятных её проявлений.

К фармакотерапии не относят использование лекарственных средств для профилактики заболеваний, а также в качестве вспомогательных средств при немедикаментозных методах лечения (например, введение анестезирующих средств при операциях) и проведении диагностических исследований (например, введение холинолитических средств для достижения гипотонии двенадцатиперстной кишки при рентгенологическом исследовании).